Oczyszczanie ścieków biogazowych obejmuje np. ścieki pochodzące z przetwarzania pozostałości fermentacyjnych, czyszczenia fermentatorów, płukania gazów i oczyszczania powietrza wywiewanego. Typowe są również pozostałości płynne zawierające związki organiczne i azotowe. Parowniki są pomocne wszędzie tam, gdzie bezpośrednie odprowadzanie ścieków jest niedozwolone.